RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 JMJD7P0C870 316 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 FBLN1P23142 703 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 PMLP29590 882 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 FLT3P36888 993 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 CDR1P51861 262 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 JAM2P57087 298 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 TAF7LQ5H9L4 462 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 CLEC4DQ8WXI8 215 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNN1Q92952 543 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM84AQ96KN4 292 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A087X0B3 334 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 ASGR2P07307 311 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT15P19012 456 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 EPHB3P54753 998 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 NCKAP1LP55160 1127 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 DLG4P78352 724 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 TUSC3Q13454 348 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 PKN1Q16512 942 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP100Q494V2 611 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM177Q53S58 311 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 MIB1Q86YT6 1006 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 PANK1Q8TE04 598 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 MZB1Q8WU39 189 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 MTFR1LQ9H019 292 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 TELO2Q9Y4R8 837 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-202ENST00000370826 DBX1A6NMT0 343 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 M0R2C6 588 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAF5O00463 557 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 N4BP3O15049 544 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 LTFP02788 710 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 NCAM1P13591 858 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 ATF2P15336 505 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 MASP1P48740 699 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 NEK4P51957 841 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 EPHA5P54756 1037 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF662Q6ZS27 426 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD1Q719H9 257 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGGTB-202ENST00000370826 CD244Q9BZW8 370 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 MAN2B1O00754 1011 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNK3O14649 394 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE8AO60658 829 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT1P04264 644 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM253P0C7T8 217 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 GLDCP23378 1020 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 FBLN7Q53RD9 439 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM126BQ8IXS8 530 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF38Q9H0F5 515 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 CBX4O00257 560 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 KPNA6O60684 536 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 LRG1P02750 347 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 MED14OSP0DP75 135 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 PFKLP17858 780 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 MC3RP41968 323 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 GRIN1Q05586 938 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 CR1LQ2VPA4 569 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 THNSL2Q86YJ6 484 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-202ENST00000370826 AHI1Q8N157 1196 aa5.56□□□□□ -1.52
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