RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 KCNJ6P48051 423 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 NFATC3Q12968 1075 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 SLFN13Q68D06 897 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 Q8N1X5 172 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 EPN3Q9H201 632 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 PATE3B3GLJ2 98 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 SUV39H1O43463 412 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 COL6A1P12109 1028 aa6.57□□□□□ -1.36
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PTPRK-202ENST00000368205 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 KRIT1O00522 736 aa6.56□□□□□ -1.36
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PTPRK-202ENST00000368205 DDAH1O94760 285 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 ACVRL1P37023 503 aa6.56□□□□□ -1.36
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PTPRK-202ENST00000368205 FXNQ16595 210 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
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PTPRK-202ENST00000368205 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 CAPN10Q9HC96 672 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 GPR27Q9NS67 375 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 CHGBP05060 677 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
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PTPRK-202ENST00000368205 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 DTX3Q8N9I9 347 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF747Q9BV97 191 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 DLL4Q9NR61 685 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 B4GALT4O60513 344 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRK-202ENST00000368205 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 VPS37DQ86XT2 251 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 DEF6Q9H4E7 631 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 JADE2Q9NQC1 790 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRK-202ENST00000368205 PTPN18Q99952 460 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 VPS11Q9H270 941 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF623O75123 536 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 SLPIP03973 132 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 ETFBP38117 255 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 GRIA2P42262 883 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 HMGA2P52926 109 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZUG5 572 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 AJUBAQ96IF1 538 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 UNCXA6NJT0 531 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 MUSKO15146 869 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 GJB6O95452 261 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRK-202ENST00000368205 USP51Q70EK9 711 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRK-202ENST00000368205 Q8TCH9 128 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 JAM3Q9BX67 310 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 A0A1W2PQU0 124 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 SLC27A2O14975 620 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 DLX3O60479 287 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 MSCO60682 206 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 KNG1P01042 644 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 FAHP16930 419 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 IER2Q9BTL4 223 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 AMHP03971 560 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-202ENST00000368205 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.49□□□□□ -1.37
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