RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364207.1

RNU6-188P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 188, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-188P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-188P-201ENST00000364207 ETV3LQ6ZN32 361 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 FAM126BQ8IXS8 530 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 KCNN1Q92952 543 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 SCYL1Q96KG9 808 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 ORAI3Q9BRQ5 295 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 SPC25Q9HBM1 224 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 ASH2LQ9UBL3 628 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 FBLN5Q9UBX5 448 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 ATP23Q9Y6H3 246 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 SLC12A8A0AV02 714 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 N4BP3O15049 544 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 PDE8AO60658 829 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 GAS7O60861 476 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 DNAJC6O75061 913 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 CKMP06732 381 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 PDE6AP16499 860 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 SDSP20132 328 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 GLDCP23378 1020 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 SCNN1BP51168 640 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 NKX3-2P78367 333 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 TMEM177Q53S58 311 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 KCTD1Q719H9 257 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 MIB1Q86YT6 1006 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 PASD1Q8IV76 773 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 CHST14Q8NCH0 376 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 CHAC2Q8WUX2 184 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 BOCQ9BWV1 1114 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 MCOLN1Q9GZU1 580 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 CAAP1Q9H8G2 361 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 IFT57Q9NWB7 429 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 DTLQ9NZJ0 730 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 SRPK3Q9UPE1 567 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 COQ6Q9Y2Z9 468 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-188P-201ENST00000364207 TCRBV5S2A0A599 114 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 M0R2C6 588 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 RFXAPO00287 272 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 SLC27A2O14975 620 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 COL6A2P12110 1019 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 KRT15P19012 456 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 MASP1P48740 699 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 EPHA5P54756 1037 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZNF174Q15697 407 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 OVCH1Q7RTY7 1134 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 KRT26Q7Z3Y9 468 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 LDHDQ86WU2 507 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 MZB1Q8WU39 189 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 WRNIP1Q96S55 665 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 CBLCQ9ULV8 474 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 H7C1D1 291 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 CBX4O00257 560 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 KPNA6O60684 536 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 CYP7B1O75881 506 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 CYP2C8P10632 490 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 PMLP29590 882 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 CNGA1P29973 690 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 STAT3P40763 770 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 DLG4P78352 724 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 TUSC3Q13454 348 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 ZNF460Q14592 562 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 C11orf74Q86VG3 221 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 OSTM1Q86WC4 334 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-188P-201ENST00000364207 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms