RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PSMA5P28066 241 aa8.79□□□□□ -1
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SGMS1-201ENST00000361543 ICAM3P32942 547 aa8.79□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 SEMA3FQ13275 785 aa8.79□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 BFSP2Q13515 415 aa8.79□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD10Q14728 455 aa8.79□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 PTGISQ16647 500 aa8.79□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.79□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 RASIP1Q5U651 963 aa8.79□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.79□□□□□ -1
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SGMS1-201ENST00000361543 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
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SGMS1-201ENST00000361543 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.78□□□□□ -1
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SGMS1-201ENST00000361543 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.76□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.76□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 ACTN1P12814 892 aa8.76□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 SELPP16109 830 aa8.76□□□□□ -1.01
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SGMS1-201ENST00000361543 RBL2Q08999 1139 aa8.76□□□□□ -1.01
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SGMS1-201ENST00000361543 AP3B2Q13367 1082 aa8.76□□□□□ -1.01
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.76□□□□□ -1.01
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