RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP36Q96G28 342 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 CALN1Q9BXU9 219 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 STAP2Q9UGK3 403 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 TMED2Q15363 201 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 LRGUKQ96M69 825 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM206Q9H813 350 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PQ27 194 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PQ64 194 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PQD8 194 aa24.25■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 HVCN1Q96D96 273 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRL2O95490 1459 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 BNIP3LO60238 219 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 PDZD8Q8NEN9 1154 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 MYL3P08590 195 aa24.25■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 PDE11AQ9HCR9 933 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 SAMD9Q5K651 1589 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 MCF2LO15068 1137 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 PLA2G4BP0C869 781 aa24.24■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 TRIM11Q96F44 468 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 CACNB3P54284 484 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 MAN2A1Q16706 1144 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 STK17AQ9UEE5 414 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 PLCG1P19174 1290 aa24.24■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 SPDL1Q96EA4 605 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC4Q9HBW1 653 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 DISP1Q96F81 1524 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 SFI1A8K8P3 1242 aa24.24■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 SUSD4Q5VX71 490 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.24■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.23■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 MED7O43513 233 aa24.23■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 PLTPP55058 493 aa24.23■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 MYO1EQ12965 1108 aa24.23■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 ANXA13P27216 316 aa24.22■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 PIGBQ92521 554 aa24.22■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 C21orf2O43822 256 aa24.22■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 CDO1Q16878 200 aa24.21■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
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PTPRM-201ENST00000332175 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 CLTAP09496 248 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 SDCCAG3Q96C92 435 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 TBK1Q9UHD2 729 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 ECEL1O95672 775 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 IRX4P78413 519 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-201ENST00000332175 RASGRF1Q13972 1273 aa24.21■■□□□ 1.47
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