RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 NFS1Q9Y697 457 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 CASZ1Q86V15 1759 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 POTEMA6NI47 508 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLRF2D3W0D1 207 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNM1LO00429 736 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHUKO15111 745 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC114Q96M63 670 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLCB1Q9NQ66 1216 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP72Q9P209 647 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAF5O00463 557 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNAQP50148 359 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC63Q05C16 580 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT25Q7Z3Z0 450 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX12PQ92771 950 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 GMNCA6NCL1 334 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYBP10242 640 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNNC1P63316 161 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF844Q08AG5 666 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC18A3Q16572 532 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC121Q6ZUS5 278 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ISCUQ9H1K1 167 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 RREB1Q92766 1687 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP2C2O75185 946 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSPY3P0CV98 308 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSPY8P0CW00 308 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 PARP10Q53GL7 1025 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM59LQ9UK28 342 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCB11O95342 1321 aa24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 PDHBP11177 359 aa24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 C12orf60Q5U649 245 aa24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ODF2Q5BJF6 829 aa24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 EDEM3Q9BZQ6 932 aa24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP104O60308 925 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERFEQ4G0M1 354 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKS1AQ92625 1134 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC37A4O43826 429 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 GJA10Q969M2 543 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAPPC3O43617 180 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPS6KA1Q15418 735 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHADLQ6NUI6 762 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAF4BQ92750 862 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSG101Q99816 390 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 HAUS2Q9NVX0 235 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXL5Q9UKA1 691 aa24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ECM1Q16610 540 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 C6orf50Q9HD87 102 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLSTN1O94985 981 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 TDP2O95551 362 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALCRLQ16602 461 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM228AQ86W67 206 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAD54LQ92698 747 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTMR9Q96QG7 549 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 GGA2Q9UJY4 613 aa24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRIG3Q6UXM1 1119 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP57Q86XR8 500 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 UIMC1Q96RL1 719 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYH4Q9Y623 1939 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SART1O43290 800 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDR1P51861 262 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAPGEF5Q92565 580 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEC16BQ96JE7 1060 aa24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITGA4P13612 1032 aa24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms