RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 UBXN2AP68543 259 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PPP2R5CQ13362 524 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MTMR1Q13613 665 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ARHGEF6Q15052 776 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 SHC4Q6S5L8 630 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 VTA1Q9NP79 307 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 HPSEQ9Y251 543 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 GPR25O00155 361 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ARP10275 920 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MUTP22033 750 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 HOXD10P28358 340 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CTGFP29279 349 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PSMC4P43686 418 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 PRMT2P55345 433 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 RDM1Q8NG50 284 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 TRIM47Q96LD4 638 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 APBA2Q99767 749 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 TINF2Q9BSI4 451 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 CSRNP2Q9H175 543 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 VAV3Q9UKW4 847 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-202ENST00000317118 MARCH6O60337 910 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 TXKP42681 527 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 GRIN1Q05586 938 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 SEMA3FQ13275 785 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 HYIQ5T013 277 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 ARMCX2Q7L311 632 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 ERO1AQ96HE7 468 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 TIGD1Q96MW7 591 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 CLIC6Q96NY7 704 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 KATNBL1Q9H079 304 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 USP25Q9UHP3 1055 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 GAS7O60861 476 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 FKTNO75072 461 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 KCNA2P16389 499 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 TXLNAP40222 546 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 TECP42680 631 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 NEDD9Q14511 834 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 NEK9Q8TD19 979 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 GPT2Q8TD30 523 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 WBP1LQ9NX94 342 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 MGAMO43451 1857 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 PFKFB1P16118 471 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 SFNP31947 248 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 KRT76Q01546 638 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 EPHA7Q15375 998 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 FSIP1Q8NA03 581 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 ERMNQ8TAM6 284 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 SCFD2Q8WU76 684 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 SDF4Q9BRK5 362 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 CUEDC2Q9H467 287 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 SRRDQ9UH36 339 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 TCHHQ07283 1943 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 TRAK2O60296 914 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 ATP9AO75110 1047 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-202ENST00000317118 ATG7O95352 703 aa6.63□□□□□ -1.35
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