RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 PNMA1Q8ND90 353 aa9.36□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CAMKK2Q96RR4 588 aa9.36□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.36□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.36□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 PALMO75781 387 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 NOL4O94818 638 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP2K2P36507 400 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 GUCY2FP51841 1108 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 SMTNP53814 917 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP2B2Q01814 1243 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 MECOMQ03112 1051 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC63Q05C16 580 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 EHHADHQ08426 723 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 UNC13DQ70J99 1090 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 RPAINQ86UA6 219 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 IFT81Q8WYA0 676 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 TMBIM4Q9HC24 238 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 MYMKA6NI61 221 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 H0YGN5 161 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 GRB10Q13322 594 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 GPATCH11Q8N954 259 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT12Q99456 494 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CEP72Q9P209 647 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 PLAAQ9Y263 795 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 NFS1Q9Y697 457 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.35□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 H0YHG0 523 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 RAD51CO43502 376 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 FTCDO95954 541 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 KLRC1P26715 233 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 BAG6P46379 1132 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 GNAQP50148 359 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 DRP2Q13474 957 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 USP38Q8NB14 1042 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 C3orf20Q8ND61 904 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 PNMA5Q96PV4 448 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CES2O00748 559 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 SERPING1P05155 500 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 TECP42680 631 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 PSEN1P49768 467 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 NT5C2P49902 561 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 ERVK-9P63128 1117 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 TFAP4Q01664 338 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 LETM2Q2VYF4 491 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 ISCUQ9H1K1 167 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 STK17AQ9UEE5 414 aa9.34□□□□□ -0.91
UBQLN3-201ENST00000311659 CLGNO14967 610 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CHUKO15111 745 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC18A3Q16572 532 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 SV2BQ7L1I2 683 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CNBD1Q8NA66 436 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 CD248Q9HCU0 757 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 KLC4Q9NSK0 619 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 A0A087X0T9 212 aa9.33□□□□□ -0.92
UBQLN3-201ENST00000311659 E7EVH7 732 aa9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms