RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 Q9Y3F1 56 aa26.94■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 SMPD1P17405 629 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.93■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 SPTLC2O15270 562 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 GAS7O60861 476 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 PPP6R2O75170 966 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 TXKP42681 527 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 METTL7BQ6UX53 244 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 FERMT2Q96AC1 680 aa26.92■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 GGPS1O95749 300 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 GH1P01241 217 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 CNGA1P29973 690 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 SPATA32Q96LK8 384 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 PKD2L1Q9P0L9 805 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 HTTP42858 3142 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 MSCO60682 206 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 KRT76Q01546 638 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 LAMC2Q13753 1193 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 PPP2R5CQ13362 524 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 PDIA5Q14554 519 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 B3GNT9Q6UX72 402 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 CYFIP1Q7L576 1253 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 GJA10Q969M2 543 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 UIMC1Q96RL1 719 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 RAB34Q9BZG1 259 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC9A2Q9UBY0 812 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC39A3-201ENST00000269740 ADCY6O43306 1168 aa26.89■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ARHGAP1Q07960 439 aa26.89■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 TMEM63BQ5T3F8 832 aa26.89■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ARMC5Q96C12 935 aa26.89■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 VAV3Q9UKW4 847 aa26.89■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 RARBP10826 455 aa26.88■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 TECP42680 631 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 IL17AQ16552 155 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 COPS5Q92905 334 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ELP1O95163 1332 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 SFNP31947 248 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 TLK2Q86UE8 772 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 RDM1Q8NG50 284 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF333Q96JL9 665 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 AK8Q96MA6 479 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 GBP4Q96PP9 640 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 AP5M1Q9H0R1 490 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 JAK3P52333 1124 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 NKX3-2P78367 333 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 PPTC7Q8NI37 304 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 SPATA33Q96N06 139 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 UNC45AQ9H3U1 944 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 WDR81Q562E7 1941 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 WDR64B1ANS9 1081 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 CCNE2O96020 404 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ME1P48163 572 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 GJA9P57773 515 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 SPC25Q9HBM1 224 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 STK24Q9Y6E0 443 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 CUTAO60888 179 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ATG7O95352 703 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC39A3-201ENST00000269740 ACTR2P61160 394 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms