RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.96■■□□□ 1.43
COX5B-201ENST00000258424 PPTC7Q8NI37 304 aa23.96■■□□□ 1.43
COX5B-201ENST00000258424 TNFRSF25Q93038 417 aa23.96■■□□□ 1.43
COX5B-201ENST00000258424 CDHR1Q96JP9 859 aa23.96■■□□□ 1.43
COX5B-201ENST00000258424 SPATA33Q96N06 139 aa23.96■■□□□ 1.43
COX5B-201ENST00000258424 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.96■■□□□ 1.43
COX5B-201ENST00000258424 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.96■■□□□ 1.43
COX5B-201ENST00000258424 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.96■■□□□ 1.43
COX5B-201ENST00000258424 ELP1O95163 1332 aa23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 FAM205CA6NFA0 338 aa23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 CIITAP33076 1130 aa23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 KRT2P35908 639 aa23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 PSMC6P62333 389 aa23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 NEDD9Q14511 834 aa23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.95■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 GRIN2DO15399 1336 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 TRIM29Q14134 588 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 INF2Q27J81 1249 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 TRIM60Q495X7 471 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 METTL7BQ6UX53 244 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 LENG9Q96B70 501 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 C8orf76Q96K31 380 aa23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 MAFGO15525 162 aa23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 CABYRO75952 493 aa23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 DEFB123Q8N688 67 aa23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 UIMC1Q96RL1 719 aa23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 BTBD18B2RXH4 712 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 TDP2O95551 362 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 ZNF286BP0CG31 522 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 USP11P51784 963 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 SP4Q02446 784 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 CUL4AQ13619 759 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 DGKDQ16760 1214 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 PRR16Q569H4 304 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 KAT2BQ92831 832 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 GPR20Q99678 358 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.92■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 KPNA6O60684 536 aa23.91■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 CDK7P50613 346 aa23.91■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.91■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.91■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 ARVCFO00192 962 aa23.9■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 GJB2P29033 226 aa23.9■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 TLE2Q04725 743 aa23.9■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 ITGA7Q13683 1181 aa23.9■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 Q7L0L9 218 aa23.9■■□□□ 1.42
COX5B-201ENST00000258424 NFASCO94856 1347 aa23.89■■□□□ 1.42
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COX5B-201ENST00000258424 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 BADQ92934 168 aa23.89■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 MBOAT7Q96N66 472 aa23.89■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.89■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 LTBP2Q14767 1821 aa23.89■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 PPFIA4O75335 1185 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 F2P00734 622 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 LGALS2P05162 132 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 CYP3A7P24462 503 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 LETM2Q2VYF4 491 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 NEK8Q86SG6 692 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 SNX21Q969T3 373 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 SDF4Q9BRK5 362 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 LAMA3Q16787 3333 aa23.87■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 WDR81Q562E7 1941 aa23.87■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.87■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 MSH4O15457 936 aa23.87■■□□□ 1.41
COX5B-201ENST00000258424 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.87■■□□□ 1.41
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