RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 BRAFP15056 766 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 MAPK4P31152 587 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TTBK2Q6IQ55 1244 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SPATA21Q7Z572 469 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 IFNL3Q8IZI9 196 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CEP19Q96LK0 163 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NLRP3Q96P20 1036 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LZTS1Q9Y250 596 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 PLCH2O75038 1416 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LGALS16A8MUM7 142 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NVLO15381 856 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NR2F2P24468 414 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SERPINB4P48594 390 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SPATA5Q8NB90 893 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SPATA4Q8NEY3 305 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LAD1O00515 517 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 MMP1P03956 469 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 FAM89AQ96GI7 184 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 FBXL5Q9UKA1 691 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 PCDHA12Q9UN75 941 aa17.32■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ARHGEF6Q15052 776 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ARHGEF9O43307 516 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TNNI1P19237 187 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SERPINB3P29508 390 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LAMB3Q13751 1172 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LRRC14Q15048 493 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 C1orf112Q9NSG2 853 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 MYL7Q01449 175 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SP4Q02446 784 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 RASSF3Q86WH2 238 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LPIN2Q92539 896 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 RHBDL2Q9NX52 303 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 EHD2Q9NZN4 543 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LLGL1Q15334 1064 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 AK8Q96MA6 479 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LRRC1Q9BTT6 524 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 KRT82Q9NSB4 513 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CAPN11Q9UMQ6 739 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 MAP3K19Q56UN5 1328 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 H7C0C1 242 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ACTN1P12814 892 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ATP5OP48047 213 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TFAP4Q01664 338 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 FAM47AQ5JRC9 791 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 RNF34Q969K3 372 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TTC17Q96AE7 1141 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 MMS19Q96T76 1030 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 DCTN4Q9UJW0 460 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 FAM107AO95990 144 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 SAT1P21673 171 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ARFIP2P53365 341 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 GFPT2O94808 682 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TMPRSS15P98073 1019 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 MTF1Q14872 753 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CENPUQ71F23 418 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CCDC125Q86Z20 511 aa17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 MED21Q13503 144 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 IQCB1Q15051 598 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TPH2Q8IWU9 490 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TRIM11Q96F44 468 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 HIC2Q96JB3 615 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D23Q9NUY8 699 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 NCK2O43639 380 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 LRIG3Q6UXM1 1119 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 GJA10Q969M2 543 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 HDAC11Q96DB2 347 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 GGT7Q9UJ14 662 aa17.29■□□□□ 0.36
CTIF-201ENST00000256413 DDAH1O94760 285 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms