RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	TIS11	P47977	285 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	AMA1	P50082	593 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RMR1	P53060	241 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	COQ6	P53318	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	EFM6	P53970	246 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YML131W	Q03102	365 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RCO1	Q04779	684 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	GMC2	Q06201	188 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YPS7	Q06325	596 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	STP4	Q07351	490 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ULA1	Q12059	462 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NSL1	Q12143	216 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ATG34	Q12292	412 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ICT1	Q12385	394 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SAS5	Q99314	248 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ARG3	P05150	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	COR1	P07256	457 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MAS1	P10507	462 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SEC63	P14906	663 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ROT2	P38138	954 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	STB5	P38699	743 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NUP60	P39705	539 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	IMA5	P40884	581 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	FKH2	P41813	862 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	UFE1	P41834	346 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MPS3	P47069	682 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	VPS25	P47142	202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MRX6	P48564	524 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CLD1	P53264	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	VPS62	P53285	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SPP2	Q02521	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NHP10	Q03435	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SMP3	Q04174	516 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	TRM12	Q04235	462 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	GGA1	Q06336	557 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	LOT6	Q07923	191 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	HIS5	P07172	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CTR86	P25355	563 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RAD51	P25454	400 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PHO91	P27514	894 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PHO11	P35842	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ALY1	P36117	915 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MRPL17	P36528	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PHO12	P38693	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	FAA2	P39518	744 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SWD1	P39706	426 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ALG8	P40351	577 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PAN6	P40459	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	CAB2	P40506	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	VHR1	P40522	640 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ELP2	P42935	788 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	BFA1	P47113	574 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ASK10	P48361	1146 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	DIA3	P52290	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	COG1	P53079	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PNG1	Q02890	363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RAD33	Q04231	177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	JLP1	Q12358	412 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	DST1	P07273	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	MRPL8	P22353	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRS33	YOR115C	PDE1	P22434	369 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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