RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	MMT2	Q08970	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	IOC2	Q12072	812 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MXR2	P25566	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MGR1	P25573	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	HXT4	P32467	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	APT2	P36973	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SLM4	P38247	162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	HXT7	P39004	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	FRT2	P39734	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SIT1	P39980	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CUP9	P41817	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MAD3	P47074	515 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	TEL2	P53038	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	XYL2	Q07993	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GLO4	Q12320	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	AI3	P03877	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	AMD2	P22580	549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CDC5	P32562	705 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	FAR3	P46671	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SHY1	P53266	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MDY2	Q12285	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	BCK2	P33306	851 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YKR015C	P36111	568 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GPI16	P38875	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YJL206C	P39529	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PEP8	P40335	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	TIM54	P47045	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ASI1	P54074	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	FDC1	Q03034	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	BOP2	Q06150	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ASA1	Q06822	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
NDC1	YML031W	SAN1	P22470	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YMC1	P32331	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	OAR1	P35731	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RIM2	P38127	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CAB2	P40506	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	NEO1	P40527	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MAD2	P40958	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ROG1	P53118	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	COG2	P53271	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ASI2	P53895	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	TVP15	Q03860	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CSN9	Q03981	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ENT4	Q07872	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PUS9	Q12069	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	NSI1	Q12457	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	HEM2	P05373	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	STE6	P12866	1290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	GRR1	P24814	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	ATO2	P32907	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	NUF2	P33895	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MCM7	P38132	845 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	PAC11	P40960	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	BIO3	P50277	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RCF2	P53721	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	BSC2	Q05611	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RAD34	Q06665	692 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YIG1	Q08956	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	VIK1	Q12045	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	MSH5	Q12175	901 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	YVC1	Q12324	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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