RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	PLB1	P39105	664 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RMD6	P39975	231 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TIR3	P40552	269 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PKP2	P53170	491 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YNL115C	P53925	644 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RIM13	Q03792	727 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RSM24	Q03976	319 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YLR031W	Q07978	186 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	GUP2	Q08929	609 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YOR019W	Q99248	730 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	STE3	P06783	470 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PET122	P10355	254 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	HOM3	P10869	527 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	IXR1	P33417	597 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	UBP11	P36026	717 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MRPL7	P36519	292 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NVJ1	P38881	321 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RAD55	P38953	406 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	AYR1	P40471	297 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	HXT9	P40885	567 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YGR201C	P42936	225 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	ZRG17	P53735	605 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	FPK1	P53739	893 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	VAC7	P53950	1165 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TIM44	Q01852	431 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MET14	Q02196	202 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	ISU1	Q03020	165 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YML020W	Q03722	664 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	COX3	P00420	269 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	BI2	P03873	423 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	GAL80	P04387	435 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CDS1	P38221	457 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YAP1801	P38856	637 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YEL023C	P39992	682 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	COG3	P40094	801 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NDE1	P40215	560 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	LAS21	P40367	830 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YFL012W	P43580	148 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	BIO3	P50277	480 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	ROG1	P53118	685 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PEX13	P80667	386 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SMA1	Q02651	245 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PEX25	Q02969	394 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SEG1	Q04279	960 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NSI1	Q12457	570 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SNF6	P18888	332 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PRI2	P20457	528 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	FUN26	P31381	517 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	ORC2	P32833	620 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	STE5	P32917	917 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PKP1	P40530	394 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	IME4	P41833	600 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SFH5	P47008	294 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	TOF2	Q02208	771 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	GAL83	Q04739	417 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	STE2	D6VTK4	431 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CDC7	P06243	507 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	KRE6	P32486	720 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MRPL3	P36516	390 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	ROT2	P38138	954 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YBR241C	P38142	488 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	AFG3	P39925	761 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	GPI8	P49018	411 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	EXG2	P52911	562 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MET13	P53128	600 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	GPI17	Q04080	534 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CDD1	Q06549	142 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	YLR126C	Q12288	251 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	COX4	P04037	155 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	HAP2	P06774	265 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	DST1	P07273	309 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	MET8	P15807	274 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ECM29	YHL030W	CDC20	P26309	610 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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