RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 NCK2O43639 380 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TTLL1O95922 423 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TUBBP07437 444 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 FAM71BQ8TC56 605 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 AGPSO00116 658 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CAPN2P17655 700 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN26Q16670 478 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 HYIQ5T013 277 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KRT79Q5XKE5 535 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TMC4Q7Z404 712 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC102AQ96A19 550 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 E9PMD0 336 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 C6orf229H3BNL8 230 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SLC1A4P43007 532 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PJA2O43164 708 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 BBOX1O75936 387 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ADRA2BP18089 450 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SLF2Q8IX21 1173 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 IQCDQ96DY2 449 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NFIAQ12857 509 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SPA17Q15506 151 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM58Q8NG06 486 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CAGE1Q8TC20 777 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PSMB7Q99436 277 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RNF40O75150 1001 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CXCR5P32302 372 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SCNN1DP51172 638 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 POTEB3A0JP26 581 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 POTECB2RU33 542 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L15C9J2P7 530 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L11C9JVI0 530 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L18D6R9N7 530 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L22D6RA61 530 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L19D6RCP7 530 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L20D6RJB6 530 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ZBTB5O15062 677 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L24Q0WX57 530 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PSMD2Q13200 908 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 GPS2Q13227 327 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 POTEBQ6S5H4 581 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CUL5Q93034 780 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TLR10Q9BXR5 811 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PANK4Q9NVE7 773 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ACTN2P35609 894 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 STAT3P40763 770 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PROM2Q8N271 834 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RAB34Q9BZG1 259 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MED4Q9NPJ6 270 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms