RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614056.4

PDCD2-215, Transcript of programmed cell death 2, human

TSL 2 BASIC

Gene PDCD2, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD2-215	ENST00000614056	REV3L	O60673	3130 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	EPOP	A6NHQ4	379 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056		E7EWF7	191 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	TNFRSF10A	O00220	468 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	GGPS1	O95749	300 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	TAP1	Q03518	808 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	CYTH3	O43739	400 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	CCND2	P30279	289 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	SP2	Q02086	613 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	NCOA7	Q8NI08	942 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	31.85	■■■□□ 2.69	1e-6	■□□□□ 11.3
PDCD2-215	ENST00000614056	HAS3	O00219	553 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	TLL1	O43897	1013 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	NBN	O60934	754 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	IL27	Q8NEV9	243 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	WNT8B	Q93098	351 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	RBL2	Q08999	1139 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	TRAF1	Q13077	416 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	PTK7	Q13308	1070 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	TCTN1	Q2MV58	587 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	KRT40	Q6A162	431 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	TRANK1	O15050	2925 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PDCD2-215	ENST00000614056	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	DEFB103A	P81534	67 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	TROAP	Q12815	778 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	SPRED2	Q7Z698	418 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	PPFIA4	O75335	1185 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	HIC1	Q14526	733 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	LCHN	A4D1U4	455 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	SGSM2	O43147	1006 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	CXCL10	P02778	98 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	ANTXR2	P58335	489 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	TFF2	Q03403	129 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	TGFB3	P10600	412 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	MYL10	Q9BUA6	226 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	MBTPS1	Q14703	1052 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PDCD2-215	ENST00000614056	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	GRB10	Q13322	594 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	THPO	P40225	353 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	IKBKE	Q14164	716 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	MAP4K1	Q92918	833 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	MUC3A	Q02505	3323 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056		H3BRB1	525 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	LGALS2	P05162	132 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	KCNQ1	P51787	676 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	SERINC5	Q86VE9	423 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PDCD2-215	ENST00000614056	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms