RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PQY0 241 aa14.28□□□□□ -0.12
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RABGEF1-209ENST00000607882 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.28□□□□□ -0.12
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RABGEF1-209ENST00000607882 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.27□□□□□ -0.12
RABGEF1-209ENST00000607882 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.27□□□□□ -0.12
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RABGEF1-209ENST00000607882 RTP1P59025 263 aa14.27□□□□□ -0.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 STXBP2Q15833 593 aa14.26□□□□□ -0.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.24□□□□□ -0.13
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.24□□□□□ -0.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.24□□□□□ -0.13
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.24□□□□□ -0.13
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RABGEF1-209ENST00000607882 USP25Q9UHP3 1055 aa14.24□□□□□ -0.13
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