RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593111.1

PSME3-216, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-216ENST00000593111 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.33■□□□□ 0.85
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PSME3-216ENST00000593111 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.33■□□□□ 0.85
PSME3-216ENST00000593111 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.33■□□□□ 0.84
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PSME3-216ENST00000593111 SP2Q02086 613 aa20.29■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 NUCB1Q02818 461 aa20.29■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 AAMPQ13685 434 aa20.29■□□□□ 0.84
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PSME3-216ENST00000593111 MBTPS1Q14703 1052 aa20.29■□□□□ 0.84
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PSME3-216ENST00000593111 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.29■□□□□ 0.84
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PSME3-216ENST00000593111 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.29■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 INSL6Q9Y581 213 aa20.29■□□□□ 0.84
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PSME3-216ENST00000593111 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.27■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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PSME3-216ENST00000593111 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 TRAF1Q13077 416 aa20.27■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 SEC23AQ15436 765 aa20.27■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.27■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 SERINC5Q86VE9 423 aa20.27■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.27■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.27■□□□□ 0.84
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PSME3-216ENST00000593111 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.27■□□□□ 0.84
PSME3-216ENST00000593111 H3BRB1 525 aa20.26■□□□□ 0.83
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PSME3-216ENST00000593111 PIGSQ96S52 555 aa20.26■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.26■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 TRDNQ13061 729 aa20.25■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.25■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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PSME3-216ENST00000593111 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 UPP2O95045 317 aa20.24■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.24■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.24■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 KCNA5P22460 613 aa20.24■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.24■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.24■□□□□ 0.83
PSME3-216ENST00000593111 TREHO43280 583 aa20.23■□□□□ 0.83
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