RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592326.1

USP36-223, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 5

Gene USP36, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-223	ENST00000592326	RAD9A	Q99638	391 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	LGR5	O75473	907 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	GJB5	O95377	273 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	F2	P00734	622 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	CXCL10	P02778	98 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	AMH	P03971	560 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	CCND2	P30279	289 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PGM5	Q15124	567 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	PIGS	Q96S52	555 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP36-223	ENST00000592326	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	HAS3	O00219	553 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	RBL2	Q08999	1139 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	OPLAH	O14841	1288 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	LPXN	O60711	386 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	RGS20	O76081	388 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	TGFB3	P10600	412 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	ERVK-21	P61565	698 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SP2	Q02086	613 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SEC23A	Q15436	765 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	WNT8B	Q93098	351 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326		H3BRB1	525 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	GRM4	Q14833	912 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	WTAP	Q15007	396 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SEPT8	Q92599	483 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	UPP2	O95045	317 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	LGALS2	P05162	132 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	CTSH	P09668	335 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	GNAT1	P11488	350 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	GHRHR	Q02643	423 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	NEDD9	Q14511	834 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	HIC1	Q14526	733 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	CUL5	Q93034	780 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.04	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	TREH	O43280	583 aa		13.04	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	SP4	Q02446	784 aa		13.04	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.04	□□□□□ -0.32
USP36-223	ENST00000592326	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.04	□□□□□ -0.32

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