RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PDILTQ8N807 584 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DISC1Q9NRI5 854 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF236Q9UL36 1845 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRA2Q96PE1 1338 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 STRNO43815 780 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 SLFN14P0C7P3 912 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 GSE1Q14687 1217 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT79Q5XKE5 535 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 GPRASP2Q96D09 838 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CALML4Q96GE6 196 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 RIT2Q99578 217 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CUEDC2Q9H467 287 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 CREBZFQ9NS37 354 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 E2F4Q16254 413 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NLRX1Q86UT6 975 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP57L1Q8IYX8 460 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF577Q9BSK1 485 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR11Q9BZH6 1224 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087X0B3 334 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SPIRE1Q08AE8 756 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR1Q13613 665 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RASSF8Q8NHQ8 419 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX58Q96C10 678 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 CDHR1Q96JP9 859 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PORCNQ9H237 461 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNH7Q9NS40 1196 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SERTAD1Q9UHV2 236 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEMA6NI47 508 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PP2D1A8MPX8 630 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD10O75832 226 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC25AP30304 524 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 LRCH2Q5VUJ6 765 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RRAGBQ5VZM2 374 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ERMNQ8TAM6 284 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PANK2Q9BZ23 570 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEF1Q9HAY2 307 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR81Q562E7 1941 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ARP10275 920 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK4P31152 587 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTN2Q02246 1040 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 NOGQ13253 232 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R5CQ13362 524 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 STXBP2Q15833 593 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR78Q5VTH9 848 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 HAUS3Q68CZ6 603 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
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CAPNS1-206ENST00000588815 MCM3APO60318 1980 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 RASSF10A6NK89 507 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 EDNRBP24530 442 aa34.9■■■■□ 3.18
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CAPNS1-206ENST00000588815 APLP1P51693 650 aa34.9■■■■□ 3.18
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CAPNS1-206ENST00000588815 NT5C3AQ9H0P0 336 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D22BQ9NU19 505 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 VAV3Q9UKW4 847 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 GAS7O60861 476 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 HYIQ5T013 277 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD17Q8N5Z5 321 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX29Q8TEQ0 813 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 TEKT3Q9BXF9 490 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC192P0DO97 292 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB115Q30KQ5 88 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 OTOP1Q7RTM1 612 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 CKAP2LQ8IYA6 745 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 GJA10Q969M2 543 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1468Q9P260 1216 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 STK17AQ9UEE5 414 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-206ENST00000588815 MGAMO43451 1857 aa34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SOWAHBA6NEL2 793 aa34.88■■■■□ 3.17
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CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH1A1P00352 501 aa34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 PDXDC2PQ6P474 469 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SASS6Q6UVJ0 657 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 FUCA2Q9BTY2 467 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 ASTN1O14525 1302 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 POSTNQ15063 836 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP4F22Q6NT55 531 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK3Q8IZD9 2030 aa34.86■■■■□ 3.17
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