RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	KCNA2	P16389	499 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	CIITA	P33076	1130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	BEX3	Q00994	111 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	NR5A1	Q13285	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	MEIS1	O00470	390 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	GH1	P01241	217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	XBP1	P17861	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	GJB2	P29033	226 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	KRT2	P35908	639 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	SNX17	Q15036	470 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	RNF180	Q86T96	592 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	TBCK	Q8TEA7	893 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	MBOAT7	Q96N66	472 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP22-211	ENST00000584538		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538		A0A1W2PQY0	241 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538		A6NJR5	290 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	WNT7A	O00755	349 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	ATP9A	O75110	1047 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	GGPS1	O95749	300 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	MMP3	P08254	477 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	AR	P10275	920 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	TGFB3	P10600	412 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	ACLY	P53396	1101 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	MTMR1	Q13613	665 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	TDP2	O95551	362 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	ASGR1	P07306	291 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	KCNA10	Q16322	511 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	INF2	Q27J81	1249 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	NFASC	O94856	1347 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	SLC37A4	O43826	429 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	SORBS3	O60504	671 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	CYP3A7	P24462	503 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.5	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	F2	P00734	622 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	CPT1A	P50416	773 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	USP11	P51784	963 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538	TRIM29	Q14134	588 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP22-211	ENST00000584538		Q4G0T1	1027 aa		13.49	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms