RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 LAD1O00515 517 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 HOXD10P28358 340 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 NLRX1Q86UT6 975 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 OR52Z1P0C646 297 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 FLT3LGP49771 235 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 PRKCZQ05513 592 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF6Q15052 776 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 TINF2Q9BSI4 451 aa21.69■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 MSH4O15457 936 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 PPP6R2O75170 966 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 RGS20O76081 388 aa21.68■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 ARP10275 920 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 MTMR1Q13613 665 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 GNPTABQ3T906 1256 aa21.68■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 MTMR9Q96QG7 549 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.68■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 ELP1O95163 1332 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 TBX3O15119 743 aa21.67■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 CCL14Q16627 93 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 HAS1Q92839 578 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 UIMC1Q96RL1 719 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.67■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 MAFGO15525 162 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 ME1P48163 572 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.66■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.66■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.65■■□□□ 1.06
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CTU2-204ENST00000564105 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.65■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 VTA1Q9NP79 307 aa21.65■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.65■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 KAT6AQ92794 2004 aa21.64■■□□□ 1.06
CTU2-204ENST00000564105 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.64■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.64■■□□□ 1.05
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CTU2-204ENST00000564105 SLC5A5Q92911 643 aa21.64■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.64■■□□□ 1.05
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CTU2-204ENST00000564105 CUTAO60888 179 aa21.63■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 MCM4P33991 863 aa21.63■■□□□ 1.05
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CTU2-204ENST00000564105 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.63■■□□□ 1.05
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CTU2-204ENST00000564105 KATNBL1Q9H079 304 aa21.63■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.63■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 ATP9AO75110 1047 aa21.62■■□□□ 1.05
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CTU2-204ENST00000564105 TECP42680 631 aa21.62■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 PRMT2P55345 433 aa21.62■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.62■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.62■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.62■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTU2-204ENST00000564105 TRIB2Q92519 343 aa21.62■■□□□ 1.05
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