RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 SPATA33Q96N06 139 aa35.29■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 BARHL2Q9NY43 387 aa35.29■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 ADCY7P51828 1080 aa35.28■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 MFSD5Q6N075 450 aa35.28■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 HIPK3Q9H422 1215 aa35.28■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 MLXIPQ9HAP2 919 aa35.28■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 RIC8AQ9NPQ8 531 aa35.28■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 PCDHA6Q9UN73 950 aa35.28■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa35.28■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 CYP2C18P33260 490 aa35.27■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 EPHB4P54760 987 aa35.27■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 CCT2P78371 535 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 SMCO2A6NFE2 343 aa35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 FIBPO43427 364 aa35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 ICAM3P32942 547 aa35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 EVCP57679 992 aa35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 NFRKBQ6P4R8 1299 aa35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 PHKBQ93100 1093 aa35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 PDRG1Q9NUG6 133 aa35.26■■■■□ 3.24
CMTM4-204ENST00000563952 PPFIA3O75145 1194 aa35.25■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF286BP0CG31 522 aa35.25■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 SCG2P13521 617 aa35.25■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 SEMA3FQ13275 785 aa35.25■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 HSDL1Q3SXM5 330 aa35.25■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 NLRX1Q86UT6 975 aa35.25■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 KAT2BQ92831 832 aa35.25■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 BCAS3Q9H6U6 928 aa35.25■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 EHMT1Q9H9B1 1298 aa35.25■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa35.24■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM199Q8N511 208 aa35.24■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 DOCK5Q9H7D0 1870 aa35.23■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 CYP2C9P11712 490 aa35.23■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 NEDD9Q14511 834 aa35.23■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 PGBD1Q96JS3 809 aa35.23■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 UMODL1Q5DID0 1318 aa35.23■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 CSF2RAP15509 400 aa35.22■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP35.22■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 NTRK3Q16288 839 aa35.22■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 CYFIP1Q7L576 1253 aa35.22■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 ALG1Q9BT22 464 aa35.22■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 SLC26A6Q9BXS9 759 aa35.22■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 PPFIA4O75335 1185 aa35.21■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 PSEN2P49810 448 aa35.21■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 PKN1Q16512 942 aa35.21■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 KATNAL1Q9BW62 490 aa35.21■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 GLT8D2Q9H1C3 349 aa35.21■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM260Q9NX78 707 aa35.21■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 NOP56O00567 594 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 ITGB5P18084 799 aa35.2■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 CCL23P55773 120 aa35.2■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 MFSD10Q14728 455 aa35.2■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 GPRASP2Q96D09 838 aa35.2■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 NOD1Q9Y239 953 aa35.2■■■■□ 3.23
CMTM4-204ENST00000563952 F2P00734 622 aa35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 FOSP01100 380 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 IFNAR1P17181 557 aa35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 STK3Q13188 491 aa35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 METTL7BQ6UX53 244 aa35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 TEX2Q8IWB9 1127 aa35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 ANO3Q9BYT9 981 aa35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa35.19■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 ANAPC15P60006 121 aa35.18■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 SP4Q02446 784 aa35.18■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 KIAA0753Q2KHM9 967 aa35.18■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 C7orf31Q8N865 590 aa35.18■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 ACRP10323 421 aa35.17■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 MTMR1Q13613 665 aa35.17■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 PTGISQ16647 500 aa35.17■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 CDHR1Q96JP9 859 aa35.17■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 SENP7Q9BQF6 1050 aa35.17■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 WNT8AQ9H1J5 351 aa35.17■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 PKD2L1Q9P0L9 805 aa35.17■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 CPLX1O14810 134 aa35.16■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 AP3B2Q13367 1082 aa35.16■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa35.16■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 SESTD1Q86VW0 696 aa35.16■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 C6orf50Q9HD87 102 aa35.16■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 HDAC6Q9UBN7 1215 aa35.16■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 LAMA3Q16787 3333 aa35.15■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 HAS3O00219 553 aa35.15■■■■□ 3.22
CMTM4-204ENST00000563952 CLK2P49760 499 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
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