RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	USP40	Q9NVE5	1235 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	PANK4	Q9NVE7	773 aa		20.39	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	LTBP1	Q14766	1721 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	EPHB6	O15197	1021 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	GYS2	P54840	703 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	PDXDC1	Q6P996	788 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC17	Q96LX7	622 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SHMT1	P34896	483 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		20.38	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	TRAF5	O00463	557 aa		20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEA1	P43355	309 aa		20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	USP11	P51784	963 aa		20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN26	Q16670	478 aa		20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CREG2	Q8IUH2	290 aa		20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	COG1	Q8WTW3	980 aa		20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CEP72	Q9P209	647 aa		20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	20.37	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF185	O15231	689 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC41	Q15345	812 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	EHD4	Q9H223	541 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	TSKS	Q9UJT2	592 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ACTN2	P35609	894 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ECM1	Q16610	540 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MCTP2	Q6DN12	878 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		20.36	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	USP17L10	C9JJH3	530 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559		F8W031	263 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	RIMBP2	O15034	1052 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	NOX5	Q96PH1	765 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	ATP2B2	Q01814	1243 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		20.35	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	MOCS3	O95396	460 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SERPING1	P05155	500 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G4B	P0C869	781 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN2	P17655	700 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CYP3A7	P24462	503 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A2	P36021	539 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CERS5	Q8N5B7	392 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	TEKT1	Q969V4	418 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	RNF14	Q9UBS8	474 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	20.34	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		20.33	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	DDR1	Q08345	913 aa		20.33	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	KCNMA1	Q12791	1236 aa		20.33	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC181	Q5TID7	509 aa		20.33	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		20.33	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD1	Q719H9	257 aa		20.33	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		20.33	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF4	Q8WV16	495 aa		20.33	■□□□□ 0.85
RRN3-205	ENST00000563559	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		20.33	■□□□□ 0.85

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