RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.11■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 PSMD10O75832 226 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 RGS20O76081 388 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 PLCG1P19174 1290 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 RGMBQ6NW40 437 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 KCNK18Q7Z418 384 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 FGD4Q96M96 766 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM20AQ96MK3 541 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 EML1O00423 815 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 POSTNQ15063 836 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 TMEM266Q2M3C6 531 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 SLFN12Q8IYM2 578 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.1■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 NR3C2P08235 984 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC10A3P09131 477 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 AFMP43652 599 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 SEMA3FQ13275 785 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 IQUBQ8NA54 791 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 ZIC5Q96T25 663 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 JADE2Q9NQC1 790 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 PNMA3Q9UL41 463 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC192P0DO97 292 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 BCRP11274 1271 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 BMP6P22004 513 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 SARSP49591 514 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 RNF214Q8ND24 703 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 SPATA20Q8TB22 786 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 MAF1Q9H063 256 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 EFCC1Q9HA90 598 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 FBXO40Q9UH90 709 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 ADGRA2Q96PE1 1338 aa16.08■□□□□ 0.17
RABGGTA-209ENST00000559551 BIN1O00499 593 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 MARCH6O60337 910 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 ATP9AO75110 1047 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 MED24O75448 989 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 STAT6P42226 847 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC25A27O95847 323 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 PGK2P07205 417 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 TXLNAP40222 546 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 DPYDQ12882 1025 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 ANO6Q4KMQ2 910 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 HYIQ5T013 277 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 NT5DC1Q5TFE4 455 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 ISM2Q6H9L7 571 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 DNAJC25Q9H1X3 360 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 USP25Q9UHP3 1055 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 PFASO15067 1338 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 CUL4BQ13620 913 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 NCAPH2Q6IBW4 605 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 ZNF577Q9BSK1 485 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 PCNTO95613 3336 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 ESPNB1AK53 854 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 PPP2R5CQ13362 524 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 RAB34Q9BZG1 259 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 UNC45AQ9H3U1 944 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC39Q9UFE4 941 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-209ENST00000559551 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms