RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555436.1

CBLN3-202, Transcript of cerebellin 3 precursor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CBLN3, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3-202ENST00000555436 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.41■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.41■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.41■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 NOD1Q9Y239 953 aa22.41■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF286BP0CG31 522 aa22.4■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 DNAJB2P25686 324 aa22.4■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 PSEN2P49810 448 aa22.4■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 PTGISQ16647 500 aa22.4■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.4■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CBLN3-202ENST00000555436 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 HAS3O00219 553 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 ZBTB43O43298 467 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 SORBS3O60504 671 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 NEFLP07196 543 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 PFKMP08237 780 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 BFSP2Q13515 415 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 MFSD10Q14728 455 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 C7orf31Q8N865 590 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 RETREG2Q8NC44 543 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.39■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 FIBPO43427 364 aa22.38■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 HSPA4P34932 840 aa22.38■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 RFC2P35250 354 aa22.38■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 RCAN1P53805 252 aa22.38■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 RTN1Q16799 776 aa22.38■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.38■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.38■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 IQCF3P0C7M6 154 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 FUT2Q10981 343 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 SEMA3FQ13275 785 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 NEDD9Q14511 834 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CAGE1Q8TC20 777 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 TIFAQ96CG3 184 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 ALG1Q9BT22 464 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 PBX4Q9BYU1 374 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.37■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 REC8O95072 547 aa22.36■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 METTL7BQ6UX53 244 aa22.36■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.36■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.36■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.36■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.36■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 PBX2P40425 430 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 FGD1P98174 961 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 UBE2SQ16763 222 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 NLRX1Q86UT6 975 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CPA1P15085 419 aa22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 RBL2Q08999 1139 aa22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF576Q9H609 170 aa22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 LGALS2P05162 132 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 SELPP16109 830 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CDC27P30260 824 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 RAB30Q15771 203 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 GPRASP2Q96D09 838 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CDHR1Q96JP9 859 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 GPR20Q99678 358 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 USP26Q9BXU7 913 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 MSRAQ9UJ68 235 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.33■■□□□ 1.17
CBLN3-202ENST00000555436 CDH23Q9H251 3354 aa22.33■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ZBBXA8MT70 800 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 H3BRB1 525 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 ACTN1P12814 892 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 NAPAP54920 295 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 PTK7Q13308 1070 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 GRIN2CQ14957 1233 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.32■■□□□ 1.16
CBLN3-202ENST00000555436 Q6ZUG5 572 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms