RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554497.1

TMEM30B-201, Transcript of transmembrane protein 30B, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM30B, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30B-201ENST00000554497 COPS5Q92905 334 aa14.65□□□□□ -0.06
TMEM30B-201ENST00000554497 A6NJR5 290 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TMEM232C9JQI7 657 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 STXBP3O00186 592 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 SLC27A2O14975 620 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ORC4O43929 436 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 KPNA6O60684 536 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CKBP12277 381 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 BMP3P12645 472 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 STAT2P52630 851 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 SNAP25P60880 206 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 NECTIN1Q15223 517 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 MKL1Q969V6 931 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CEP95Q96GE4 821 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 SAMD11Q96NU1 681 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.64□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CACNA1GO43497 2377 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TSPY2A6NKD2 308 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 FGRP09769 529 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TSPY3P0CV98 308 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TSPY8P0CW00 308 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ZXDAP98168 799 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 MBTPS1Q14703 1052 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 PPP2R5BQ15173 497 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 RNF20Q5VTR2 975 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 SLFN13Q68D06 897 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.63□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 B4E1Z4 1266 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 PROB1E7EW31 1015 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 H0Y858 1186 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TBX10O75333 385 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TFAP4Q01664 338 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 HYAL1Q12794 435 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 SESTD1Q86VW0 696 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 FBXO11Q86XK2 927 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TMEM192Q8IY95 271 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TLR9Q9NR96 1032 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.62□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 E7EWF7 191 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 NCK2O43639 380 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 AMHP03971 560 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 AVPR2P30518 371 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 HSPA4P34932 840 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TRDNQ13061 729 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 FAM160B2Q86V87 743 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ESR2Q92731 530 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 WNT8BQ93098 351 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 KRT23Q9C075 422 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.61□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 PRR23AA6NEV1 266 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 KDM4AO75164 1064 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 LGR5O75473 907 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 SEC24BO95487 1268 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TTLL1O95922 423 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 MCCP23508 829 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ID4P47928 161 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ASIC4Q96FT7 647 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 USP26Q9BXU7 913 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CD207Q9UJ71 328 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.6□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 LINC01565O15544 149 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 RGS20O76081 388 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 ARIH2O95376 493 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 RASEFQ8IZ41 740 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.59□□□□□ -0.07
TMEM30B-201ENST00000554497 NCOA7Q8NI08 942 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms