RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 PIK3CDO00329 1044 aa37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 PPFIA4O75335 1185 aa37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 F2P00734 622 aa37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 HSDL1Q3SXM5 330 aa37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 USP17L6PQ6QN14 398 aa37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 MICU3Q86XE3 530 aa37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC155Q8N6L0 562 aa37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 ALG1Q9BT22 464 aa37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 SCN5AQ14524 2016 aa37.24■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 IQCF3P0C7M6 154 aa37.23■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 MFSD10Q14728 455 aa37.23■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 TMTC3Q6ZXV5 915 aa37.23■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 MLXIPQ9HAP2 919 aa37.23■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa37.23■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 TANC1Q9C0D5 1861 aa37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 MEIS2O14770 477 aa37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 RAB30Q15771 203 aa37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 KIAA0753Q2KHM9 967 aa37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 TSGA10IPQ3SY00 556 aa37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC82Q8N4S0 544 aa37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 HDAC6Q9UBN7 1215 aa37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 MSRAQ9UJ68 235 aa37.22■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 ZBBXA8MT70 800 aa37.21■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 HAS3O00219 553 aa37.21■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 GRIN2CQ14957 1233 aa37.21■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 CAGE1Q8TC20 777 aa37.21■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 FOSL2P15408 326 aa37.2■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 ICAM3P32942 547 aa37.2■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 KRT32Q14532 448 aa37.2■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 APOA5Q6Q788 366 aa37.2■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 RASEFQ8IZ41 740 aa37.2■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 CTAGE1Q96RT6 745 aa37.2■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 PSTPIP2Q9H939 334 aa37.2■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 RTEL1Q9NZ71 1219 aa37.2■■■■□ 3.55
TTC7B-202ENST00000553948 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa37.19■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 ACTN1P12814 892 aa37.19■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 PCNX4Q63HM2 1172 aa37.19■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 XRRA1Q6P2D8 792 aa37.19■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa37.18■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 FIBPO43427 364 aa37.18■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 ADCK5Q3MIX3 580 aa37.18■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 AFAP1L1Q8TED9 768 aa37.18■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 TCEANC2Q96MN5 208 aa37.18■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 NEDD9Q14511 834 aa37.17■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP37.17■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 GBF1Q92538 1859 aa37.17■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 BCAS3Q9H6U6 928 aa37.16■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 NOP56O00567 594 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 SEMA3FQ13275 785 aa37.15■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa37.15■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 C16orf70Q9BSU1 422 aa37.15■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 ZBTB43O43298 467 aa37.14■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 SELPP16109 830 aa37.14■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 METTL7BQ6UX53 244 aa37.14■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 CYFIP1Q7L576 1253 aa37.14■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa37.14■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 BRPF3Q9ULD4 1205 aa37.14■■■■□ 3.54
TTC7B-202ENST00000553948 RBL2Q08999 1139 aa37.13■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 PTK7Q13308 1070 aa37.13■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 RTN1Q16799 776 aa37.13■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 NLRX1Q86UT6 975 aa37.13■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 CDH23Q9H251 3354 aa37.12■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 RABGGTBP53611 331 aa37.12■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 UBE2SQ16763 222 aa37.12■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC8DQ7L1W4 858 aa37.12■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 SLC28A3Q9HAS3 691 aa37.12■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 H3BRB1 525 aa37.11■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 LGALS2P05162 132 aa37.11■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 CKBP12277 381 aa37.11■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP37.11■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa37.11■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 DOCK5Q9H7D0 1870 aa37.11■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa37.1■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 SPDYE3A6NKU9 549 aa37.1■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 PARNO95453 639 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 SENP7Q9BQF6 1050 aa37.1■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 USP26Q9BXU7 913 aa37.1■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa37.09■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 GPR20Q99678 358 aa37.09■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 TET1Q8NFU7 2136 aa37.09■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 GOLGA8AA7E2F4 631 aa37.08■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 GOLGA8BA8MQT2 603 aa37.08■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 DLL1O00548 723 aa37.08■■■■□ 3.53
TTC7B-202ENST00000553948 FGD1P98174 961 aa37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms