RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 USP6NLQ92738 828 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ERO1AQ96HE7 468 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MAML3Q96JK9 1138 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 AK8Q96MA6 479 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 ZNF577Q9BSK1 485 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 MRVI1Q9Y6F6 885 aa13.53□□□□□ -0.24
LMO3-218ENST00000538020 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 MSH4O15457 936 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 FKTNO75072 461 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 MBD3O95983 291 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 GNRH1P01148 92 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 HOXD10P28358 340 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TXKP42681 527 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 KCNV1Q6PIU1 500 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ARMCX2Q7L311 632 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 HAS1Q92839 578 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TRIM47Q96LD4 638 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 WDR11Q9BZH6 1224 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 KCNH7Q9NS40 1196 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 FAM13BQ9NYF5 915 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 GJD2Q9UKL4 321 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 PCDHA12Q9UN75 941 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa13.52□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 GAS7O60861 476 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ARP10275 920 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 CMA1P23946 247 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 CTGFP29279 349 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ICAM3P32942 547 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TXLNAP40222 546 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 PDIA5Q14554 519 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 OLFML2BQ68BL8 750 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SLC5A5Q92911 643 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 CLIC6Q96NY7 704 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 RIT2Q99578 217 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TINF2Q9BSI4 451 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TEKT3Q9BXF9 490 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 CSRNP2Q9H175 543 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 VTA1Q9NP79 307 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 STK24Q9Y6E0 443 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa13.51□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 NFASCO94856 1347 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 PSMD10O75832 226 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TGFB3P10600 412 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 CYP2B6P20813 491 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TECP42680 631 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 GRIN1Q05586 938 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 IRF5Q13568 498 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 RESP18Q5W5W9 173 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 IGSF22Q8N9C0 903 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 FSIP1Q8NA03 581 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SDF4Q9BRK5 362 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 WBP1LQ9NX94 342 aa13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 DOCK3Q8IZD9 2030 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 RGS20O76081 388 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SEMA3FQ13275 785 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 PPP2R5CQ13362 524 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 IL17AQ16552 155 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SHC4Q6S5L8 630 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 EEPD1Q7L9B9 569 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ERMNQ8TAM6 284 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SCFD2Q8WU76 684 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SENP7Q9BQF6 1050 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 LRWD1Q9UFC0 647 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 MCM3APO60318 1980 aa13.49□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa13.48□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 SLC26A4O43511 780 aa13.48□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 PFKFB1P16118 471 aa13.48□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 KCNA2P16389 499 aa13.48□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 UBA7P41226 1012 aa13.48□□□□□ -0.25
LMO3-218ENST00000538020 FLT3LGP49771 235 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms