RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531006.1

TSTA3-213, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-213ENST00000531006 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 SMCO2A6NFE2 343 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 KAT2BQ92831 832 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 SPATA33Q96N06 139 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 TMEM260Q9NX78 707 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 BARHL2Q9NY43 387 aa23.61■■□□□ 1.37
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TSTA3-213ENST00000531006 CYP2C9P11712 490 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 STK3Q13188 491 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 DGKDQ16760 1214 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.6■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.59■■□□□ 1.37
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TSTA3-213ENST00000531006 ADCY7P51828 1080 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 EVCP57679 992 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 FPGSQ05932 587 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 NTRK3Q16288 839 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 PKN1Q16512 942 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 GNPTABQ3T906 1256 aa23.59■■□□□ 1.37
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TSTA3-213ENST00000531006 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 ALG1Q9BT22 464 aa23.59■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.59■■□□□ 1.37
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TSTA3-213ENST00000531006 CSF2RAP15509 400 aa23.58■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 ICAM3P32942 547 aa23.58■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 CCL23P55773 120 aa23.58■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 MFSD5Q6N075 450 aa23.58■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.58■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 HIPK3Q9H422 1215 aa23.58■■□□□ 1.37
TSTA3-213ENST00000531006 DTNBO60941 627 aa23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 STAM2O75886 525 aa23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 ACRP10323 421 aa23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 ITGB5P18084 799 aa23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 SP4Q02446 784 aa23.57■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.57■■□□□ 1.36
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TSTA3-213ENST00000531006 ATP9AO75110 1047 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 PSEN2P49810 448 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.56■■□□□ 1.36
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TSTA3-213ENST00000531006 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 NLRX1Q86UT6 975 aa23.56■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 SCN5AQ14524 2016 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 PPFIA4O75335 1185 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 TMEM199Q8N511 208 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 SCLYQ96I15 445 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.55■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 IFNAR1P17181 557 aa23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 NEDD9Q14511 834 aa23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 MFSD10Q14728 455 aa23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.361e-6■■■□□ 17.6
TSTA3-213ENST00000531006 ANO3Q9BYT9 981 aa23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.54■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 PTGISQ16647 500 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.53■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 METTL7BQ6UX53 244 aa23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 C7orf31Q8N865 590 aa23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 GPRASP2Q96D09 838 aa23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-213ENST00000531006 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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