RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 F2P00734 622 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 FGBP02675 491 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 PSEN2P49810 448 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 FUT2Q10981 343 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNV1Q6PIU1 500 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA33Q96N06 139 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 HAS3O00219 553 aa27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 TGFB3P10600 412 aa27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 PTGISQ16647 500 aa27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 PBX4Q9BYU1 374 aa27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 TELO2Q9Y4R8 837 aa27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 ICAM3P32942 547 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 HIC1Q14526 733 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 MFSD10Q14728 455 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 UBE2SQ16763 222 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 ALG1Q9BT22 464 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-204ENST00000528201 CHD9Q3L8U1 2897 aa27.58■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 KRT32Q14532 448 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 DEFB128Q7Z7B8 93 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 CUL5Q93034 780 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 PITPNM1O00562 1244 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 ZBTB43O43298 467 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 PPFIA4O75335 1185 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 IQCF3P0C7M6 154 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 HSPA4P34932 840 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 RTN1Q16799 776 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 PCNX4Q63HM2 1172 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 MYLIPQ8WY64 445 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 TIFAQ96CG3 184 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 NOD1Q9Y239 953 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.56■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 STAM2O75886 525 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 GRIN2CQ14957 1233 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 GNPTABQ3T906 1256 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 MLXIPQ9HAP2 919 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 FIBPO43427 364 aa27.54■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 CDC27P30260 824 aa27.54■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 GPNMBQ14956 572 aa27.54■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 C7orf31Q8N865 590 aa27.54■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC17A8Q8NDX2 589 aa27.54■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 WNT8BQ93098 351 aa27.54■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.54■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLGA8AA7E2F4 631 aa27.53■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27.53■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 BFSP2Q13515 415 aa27.53■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 METTL7BQ6UX53 244 aa27.53■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.53■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 RETREG2Q8NC44 543 aa27.53■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF576Q9H609 170 aa27.53■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 UNC80Q8N2C7 3258 aa27.52■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 PFKMP08237 780 aa27.52■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 XRRA1Q6P2D8 792 aa27.52■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PACSIN3-204ENST00000528201 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 LGALS2P05162 132 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 ITGB5P18084 799 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 RFC2P35250 354 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 RBL2Q08999 1139 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 APOBRQ0VD83 1088 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 NEDD9Q14511 834 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 CAGE1Q8TC20 777 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 GPR20Q99678 358 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 RABGGTBP53611 331 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 Q6ZUG5 572 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM50Q86XT4 487 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 AFAP1L1Q8TED9 768 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 CHD7Q9P2D1 2997 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 ZBBXA8MT70 800 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 STXBP3O00186 592 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP9AO75110 1047 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 CKBP12277 381 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
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