RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 E7EVH7 732 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R37O75864 691 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 FGAP02671 866 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 CTDSPL2Q05D32 466 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 PSMD2Q13200 908 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 RWDD2BP57060 319 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 PTPAQ15257 358 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 FAM83AQ86UY5 434 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 MYO1AQ9UBC5 1043 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 OPA1O60313 960 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 RPS6KA3P51812 740 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 SLC8A3P57103 927 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 TFAP4Q01664 338 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ICA1Q05084 483 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM67Q5HYA8 995 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 BRAPQ7Z569 592 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 SAAL1Q96ER3 474 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TRPS1-211ENST00000520276 ASNSP08243 561 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 NFIAQ12857 509 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 E7EWF7 191 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 GDF11O95390 407 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 MYBL1P10243 752 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 POSTNQ15063 836 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 QPCTQ16769 361 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 CATIPQ7Z7H3 387 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 RUFY1Q96T51 708 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 NUP58Q9BVL2 599 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF233A6NK53 670 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 FAM196BA6NMK8 535 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 CNGA4Q8IV77 575 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf20Q8ND61 904 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 CDCA5Q96FF9 252 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 FLT1P17948 1338 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 CASP1P29466 404 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 RAB27AP51159 221 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 MORC3Q14149 939 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 WTAPQ15007 396 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 FAM107AO95990 144 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 ECE1P42892 770 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D25Q3MII6 688 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 FECHP22830 423 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 SCTRP47872 440 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 TMTC2Q8N394 836 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 MLKLQ8NB16 471 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms