RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-215	ENST00000502470	SPATA33	Q96N06	139 aa		31.2	■■■□□ 2.59
MIB2-215	ENST00000502470	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
MIB2-215	ENST00000502470	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
MIB2-215	ENST00000502470	STAM2	O75886	525 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	FUT2	Q10981	343 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	SEMA3F	Q13275	785 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	VWCE	Q96DN2	955 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	GUCD1	Q96NT3	240 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	F2	P00734	622 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	ICAM3	P32942	547 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	PSEN2	P49810	448 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	PTGIS	Q16647	500 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	UBE2S	Q16763	222 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	SESTD1	Q86VW0	696 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	ALG1	Q9BT22	464 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	TET1	Q8NFU7	2136 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	HAS3	O00219	553 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	REC8	O95072	547 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	FGB	P02675	491 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	CDC27	P30260	824 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470		Q6ZUG5	572 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	HERVK_113	Q902F9	699 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	NOD1	Q9Y239	953 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	PPFIA4	O75335	1185 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	FGD1	P98174	961 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	APOBR	Q0VD83	1088 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	MFSD10	Q14728	455 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	FIBP	O43427	364 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		31.14	■■■□□ 2.58
MIB2-215	ENST00000502470	PITPNM1	O00562	1244 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	DNAJB2	P25686	324 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	RCAN1	P53805	252 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	C7orf31	Q8N865	590 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	BRF1	Q92994	677 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	IQCF3	P0C7M6	154 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	RPS6KB1	P23443	525 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	NAPA	P54920	295 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	NEDD9	Q14511	834 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		31.11	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	PBX2	P40425	430 aa		31.11	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	31.11	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	BFSP2	Q13515	415 aa		31.11	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	METTL7B	Q6UX53	244 aa		31.11	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	RETREG2	Q8NC44	543 aa		31.11	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	NLRX1	Q86UT6	975 aa		31.1	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	PBX4	Q9BYU1	374 aa		31.1	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		31.1	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	KAT6A	Q92794	2004 aa		31.1	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	STXBP3	O00186	592 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	LGALS2	P05162	132 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	PFKM	P08237	780 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	ITGB5	P18084	799 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	HIC1	Q14526	733 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	FBXL16	Q8N461	479 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	CAGE1	Q8TC20	777 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	GPR20	Q99678	358 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MIB2-215	ENST00000502470	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		31.09	■■■□□ 2.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms