RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB14	A6NK59	587 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTN2	Q02246	1040 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA3F	Q13275	785 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE3C	Q15386	1083 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SCLY	Q96I15	445 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CERS4	Q9HA82	394 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH8	P13535	1937 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	NCOR1	O75376	2440 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ERC2	O15083	957 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	B4GALT4	O60513	344 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRA1	O75019	489 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CHGB	P05060	677 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTN1	P12814	892 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	RASA1	P20936	1047 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	OAZ1	P54368	228 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMC6	P62333	389 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FGD4	Q96M96	766 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF146	Q9NTX7	359 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	RFXAP	O00287	272 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAGE5	O15320	804 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB11FIP3	O75154	756 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	APP	P05067	770 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CA3	P07451	260 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PFKM	P08237	780 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP3	P12645	472 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5J	P18859	108 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TDO2	P48775	406 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SLFN13	Q68D06	897 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	POM121	Q96HA1	1249 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	HAUS7	Q99871	368 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	COG5	Q9UP83	839 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ASTN1	O14525	1302 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PARP14	Q460N5	1801 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF28P	B7ZC32	967 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM232	C9JQI7	657 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM1	O75626	825 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL1	O95922	423 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ADH1A	P07327	375 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ALAS1	P13196	640 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	STAT2	P52630	851 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PANK1	Q8TE04	598 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP95	Q96GE4	821 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	KATNBL1	Q9H079	304 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CYLD	Q9NQC7	956 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CCER2	I3L3R5	266 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2C9	P11712	490 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGS1	P23219	599 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	NKX3-2	P78367	333 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL4	Q14679	1199 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TKFC	Q3LXA3	575 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SBK1	Q52WX2	424 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	RETREG2	Q8NC44	543 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIN2D	O15399	1336 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINT1	O43278	529 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL3	P08590	195 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPY3	P0CV98	308 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPY8	P0CW00	308 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC1A4	P43007	532 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	NSMF	Q6X4W1	530 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM160B2	Q86V87	743 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SKAP2-209	ENST00000497511	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		12.84	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms