RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497483.1

HDAC10-219, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 2

Gene HDAC10, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-219	ENST00000497483	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		28.58	■■■□□ 2.17
HDAC10-219	ENST00000497483	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		28.58	■■■□□ 2.17
HDAC10-219	ENST00000497483	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		28.58	■■■□□ 2.17
HDAC10-219	ENST00000497483	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
HDAC10-219	ENST00000497483	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
HDAC10-219	ENST00000497483	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
HDAC10-219	ENST00000497483	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		28.58	■■■□□ 2.17
HDAC10-219	ENST00000497483	NOD1	Q9Y239	953 aa		28.58	■■■□□ 2.17
HDAC10-219	ENST00000497483	CDH23	Q9H251	3354 aa		28.58	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	PPFIA4	O75335	1185 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	PSEN2	P49810	448 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	PTGIS	Q16647	500 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	CAGE1	Q8TC20	777 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	28.57	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	SPATA33	Q96N06	139 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	ZNF286B	P0CG31	522 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	RBL2	Q08999	1139 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	MFSD10	Q14728	455 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	KCNB2	Q92953	911 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	PBX4	Q9BYU1	374 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	FIBP	O43427	364 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	RCAN1	P53805	252 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	TIFA	Q96CG3	184 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	TET1	Q8NFU7	2136 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	IQCF3	P0C7M6	154 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	CHMP4BP1	P59074	171 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	SEMA3F	Q13275	785 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	C7orf31	Q8N865	590 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	RETREG2	Q8NC44	543 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	NEDD9	Q14511	834 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	RAB30	Q15771	203 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	ZBTB43	O43298	467 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	HSPA4	P34932	840 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	RTN1	Q16799	776 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	METTL7B	Q6UX53	244 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	ALG1	Q9BT22	464 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HDAC10-219	ENST00000497483	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	SORBS3	O60504	671 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	PBX2	P40425	430 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	FUT2	Q10981	343 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	MYLIP	Q8WY64	445 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	ZNF576	Q9H609	170 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		28.51	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	ACTN1	P12814	892 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	NLRX1	Q86UT6	975 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	LGALS2	P05162	132 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	PTK7	Q13308	1070 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	GPRASP2	Q96D09	838 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	MSRA	Q9UJ68	235 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	PTPRS	Q13332	1948 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	NID2	Q14112	1375 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	REC8	O95072	547 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	SELP	P16109	830 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	HOXC8	P31273	242 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	GRIN2C	Q14957	1233 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	UBE2S	Q16763	222 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	EYS	Q5T1H1	3165 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	ZBBX	A8MT70	800 aa		28.47	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483		H3BRB1	525 aa		28.47	■■■□□ 2.15
HDAC10-219	ENST00000497483	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15

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