RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 NETO2Q8NC67 525 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXW5Q969U6 566 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 CBLCQ9ULV8 474 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A087X0B3 334 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 OR14I1A6ND48 311 aa4.68□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 WNT9AO14904 365 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE8AO60658 829 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 KPNA6O60684 536 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 DGKIO75912 1065 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 MPOP05164 745 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 JMJD7P0C870 316 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 MASP1P48740 699 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 ST5P78524 1137 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM10P98175 930 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 IRF2BP1Q8IU81 584 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMD15Q9P1V8 674 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 B4E1Z4 1266 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R2C6 588 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 SGSM2O43147 1006 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC6A11P48066 632 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 NEK4P51957 841 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 NR1I3Q14994 352 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 CFAP100Q494V2 611 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 STEAP3Q658P3 488 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 OVCH1Q7RTY7 1134 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF605Q86T29 641 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 SEC14L1Q92503 715 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 DIRC2Q96SL1 478 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 KCNK12Q9HB15 430 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD62A6NC57 917 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNK3O14649 394 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC27A2O14975 620 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 AMY2AP04746 511 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE6AP16499 860 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT15P19012 456 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 AMY2BP19961 511 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 MAPKAPK2P49137 400 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 JAM2P57087 298 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 MLANAQ16655 118 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM177Q53S58 311 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 EMC4Q5J8M3 183 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF180Q86T96 592 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 OSTM1Q86WC4 334 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-211ENST00000489450 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-211ENST00000489450 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.66□□□□□ -1.66
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