RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF186Q9NXI6 227 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CSADQ9Y600 493 aa11.64□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RPTORQ8N122 1335 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 NFIBO00712 420 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MSH4O15457 936 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 DSG3P32926 999 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RAD54LQ92698 747 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 GJA10Q969M2 543 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM9Q9C026 710 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 FANCLQ9NW38 375 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PARP14Q460N5 1801 aa11.63□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MYPNQ86TC9 1320 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CBFA2T2O43439 604 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 KLRC4O43908 158 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CAPN15O75808 1086 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RHOBTB3O94955 611 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 GJA5P36382 358 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 STAT3P40763 770 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ASIC1P78348 528 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 FANCCQ00597 558 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 COG2Q14746 738 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP55Q53EZ4 464 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA1Q5VX52 437 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SPRYD7Q5W111 196 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 REPS2Q8NFH8 660 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 EXOC1Q9NV70 894 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 IFNKQ9P0W0 207 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 VAV3Q9UKW4 847 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SERPINC1P01008 464 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP1A3P13637 1013 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF18P17022 549 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 UBXN2AP68543 259 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PAK1Q13153 545 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 STIM1Q13586 685 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MCM6Q14566 821 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MUM1L1Q5H9M0 696 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 NCAPH2Q6IBW4 605 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC5A5Q92911 643 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 UIMC1Q96RL1 719 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MED15Q96RN5 788 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF146Q9NTX7 359 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 COL20A1Q9P218 1284 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RWDD2AQ9UIY3 292 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 GDAQ9Y2T3 454 aa11.61□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MYMKA6NI61 221 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 UNCXA6NJT0 531 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MEIS1O00470 390 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP2A1O14983 1001 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPA1O75762 1119 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R2P41236 205 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 TM4SF4P48230 202 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PPATQ06203 517 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PDE4DQ08499 809 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ECM1Q16610 540 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 TKFCQ3LXA3 575 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.6□□□□□ -0.55
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