RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482686.5

PRKCZ-218, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-218ENST00000482686 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 PPTC7Q8NI37 304 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.39■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.39■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 CCL23P55773 120 aa21.38■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.38■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 SPATA33Q96N06 139 aa21.38■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 ICAM3P32942 547 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.011e-14■□□□□ 10.6
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PRKCZ-218ENST00000482686 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.37■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.36■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 FIBPO43427 364 aa21.36■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 STAM2O75886 525 aa21.36■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 TET1Q8NFU7 2136 aa21.35■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.34■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.34■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 SCG2P13521 617 aa21.34■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 ITGB5P18084 799 aa21.34■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 EVCP57679 992 aa21.34■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 MFSD10Q14728 455 aa21.34■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.34■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 VWCEQ96DN2 955 aa21.34■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 SP4Q02446 784 aa21.33■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 NLRX1Q86UT6 975 aa21.33■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 SESTD1Q86VW0 696 aa21.33■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.33■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 IL23AQ9NPF7 189 aa21.33■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.33■■□□□ 1.01
PRKCZ-218ENST00000482686 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.33■■□□□ 1.01
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PRKCZ-218ENST00000482686 ATP9AO75110 1047 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 NEDD9Q14511 834 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 HIC1Q14526 733 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 PTGISQ16647 500 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 GPR153Q6NV75 609 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 METTL7BQ6UX53 244 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 DEFB123Q8N688 67 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 GPRASP2Q96D09 838 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 KAT6AQ92794 2004 aa21.32■■□□□ 1
PRKCZ-218ENST00000482686 PPFIA4O75335 1185 aa21.31■■□□□ 1
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