RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 ALG1Q9BT22 464 aa15.02■□□□□ -0
HPS1-211ENST00000478087 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.02■□□□□ -0
HPS1-211ENST00000478087 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 DNAJB2P25686 324 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PSEN2P49810 448 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 GNAQP50148 359 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 TRAF1Q13077 416 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PTGISQ16647 500 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 DGKDQ16760 1214 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 UBE2SQ16763 222 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 RNF20Q5VTR2 975 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 APOA5Q6Q788 366 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PPTC7Q8NI37 304 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 MYLIPQ8WY64 445 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 HERVK_113Q902F9 699 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 SPATA33Q96N06 139 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 CALM1P0DP23 149 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 CALM2P0DP24 149 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 CALM3P0DP25 149 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 CDC27P30260 824 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 GPNMBQ14956 572 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 GRIN2CQ14957 1233 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 TYW1BQ6NUM6 668 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 WNT8BQ93098 351 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PBX4Q9BYU1 374 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PSTPIP2Q9H939 334 aa15□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 HAS3O00219 553 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PIK3CDO00329 1044 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 IQCF3P0C7M6 154 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 MYOGP15173 224 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 RABGGTBP53611 331 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 FUT2Q10981 343 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 MFSD10Q14728 455 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 KCNB2Q92953 911 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 REV3LO60673 3130 aa14.99□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 ZBTB43O43298 467 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PPFIA4O75335 1185 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 F2P00734 622 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 TGFB3P10600 412 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 APOBRQ0VD83 1088 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 SESTD1Q86VW0 696 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 C7orf31Q8N865 590 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 CUL5Q93034 780 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 TIFAQ96CG3 184 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 NOD1Q9Y239 953 aa14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 ADAMTS3O15072 1205 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 ATP9AO75110 1047 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 ICAM3P32942 547 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 HSPA4P34932 840 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 SP4Q02446 784 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 RTN1Q16799 776 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 TCTN1Q2MV58 587 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZUG5 572 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 RETREG2Q8NC44 543 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PGBD1Q96JS3 809 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 ZNF576Q9H609 170 aa14.97□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 ZBBXA8MT70 800 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PPFIA3O75145 1194 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 ITGB5P18084 799 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 TRIM50Q86XT4 487 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms