RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 HOXC8P31273 242 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ARHGEF16Q5VV41 709 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 CNKSR3Q6P9H4 555 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 STOX1Q6ZVD7 989 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 VSIG10LQ86VR7 867 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 DSCC1Q9BVC3 393 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 KAT14Q9H8E8 782 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PNMA2Q9UL42 364 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 MYO7AQ13402 2215 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 RAD50Q92878 1312 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 ERVK-21P61565 698 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PTH1RQ03431 593 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PTK7Q13308 1070 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PGM5Q15124 567 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 DGKDQ16760 1214 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PPTC7Q8NI37 304 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PIGSQ96S52 555 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 C17orf80Q9BSJ5 609 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 LRFN3Q9BTN0 628 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 NOD1Q9Y239 953 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 MRVI1Q9Y6F6 885 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-206ENST00000474188 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 KLRF2D3W0D1 207 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 GGPS1O95749 300 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 LAMC2Q13753 1193 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 IQCA1Q86XH1 822 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 RIOX1Q9H6W3 641 aa12.64□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MYH7BA7E2Y1 1941 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 TREHO43280 583 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 CYP21A2P08686 494 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 LINC00271P0C7V0 271 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 ANTXR2P58335 489 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 GRM4Q14833 912 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 SERINC5Q86VE9 423 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MCF2L2Q86YR7 1114 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 C7orf31Q8N865 590 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 HLA-CQ95604 372 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 RAD9AQ99638 391 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 AMNQ9BXJ7 453 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MAF1Q9H063 256 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 FAM86C2PA6NEL3 165 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 KIF28PB7ZC32 967 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 ZBTB5O15062 677 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 PPFIA4O75335 1185 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 KCNJ6P48051 423 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 TROAPQ12815 778 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 TRIM50Q86XT4 487 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 HOMER1Q86YM7 354 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 SPATA33Q96N06 139 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 RNPEPQ9H4A4 650 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 COG5Q9UP83 839 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 FRMPD4Q14CM0 1322 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 B4DLN1 442 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 LGALS2P05162 132 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 IL9P15248 144 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 PLA2G5P39877 138 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 ADAM17P78536 824 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 CCDC178Q5BJE1 867 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 FCHSD1Q86WN1 690 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MUC6Q6W4X9 2439 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MYH6P13533 1939 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 RSPH10B2B2RC85 870 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 RSPH10BP0C881 870 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 THPOP40225 353 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 CCDC155Q8N6L0 562 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 ZBED2Q9BTP6 218 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 KRT23Q9C075 422 aa12.6□□□□□ -0.39
NISCH-206ENST00000474188 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms