RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 MYO9BQ13459 2157 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 CFBP00751 764 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 AFG1LQ8WV93 481 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 RABGGTBP53611 331 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 STXBP2Q15833 593 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SYP-205ENST00000472598 KPNA6O60684 536 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 IWS1Q96ST2 819 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 MSRAQ9UJ68 235 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 VCANP13611 3396 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 CUL9Q8IWT3 2517 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 ZBBXA8MT70 800 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 GH1P01241 217 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 NR3C2P08235 984 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 MYOGP15173 224 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 ARHGAP1Q07960 439 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 NTRK3Q16288 839 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 USP38Q8NB14 1042 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PPM1EQ8WY54 764 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PXMP2Q9NR77 195 aa21.38■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 SORBS3O60504 671 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 MMP3P08254 477 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 TRAF1Q13077 416 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 AK2P54819 239 aa21.36■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 RAB30Q15771 203 aa21.36■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.36■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 KAT2BQ92831 832 aa21.36■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 KIF2CQ99661 725 aa21.36■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 SCN5AQ14524 2016 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 MEIS2O14770 477 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PPFIA3O75145 1194 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 POLR2MP0CAP2 368 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 RETREG2Q8NC44 543 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 IL31RAQ8NI17 732 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PHKBQ93100 1093 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 NOD1Q9Y239 953 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.35■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 IQCF3P0C7M6 154 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PKN1Q16512 942 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PTGISQ16647 500 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 ALG1Q9BT22 464 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.34■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 STXBP3O00186 592 aa21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PIK3CDO00329 1044 aa21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 RGS20O76081 388 aa21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 IFNAR1P17181 557 aa21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 IGFBP4P22692 258 aa21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 STK3Q13188 491 aa21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 ADGRE1Q14246 886 aa21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.33■■□□□ 1.01
SYP-205ENST00000472598 LARGE1O95461 756 aa21.32■■□□□ 1
SYP-205ENST00000472598 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYP-205ENST00000472598 SCRN1Q12765 414 aa21.32■■□□□ 1
SYP-205ENST00000472598 PGM5Q15124 567 aa21.32■■□□□ 1
SYP-205ENST00000472598 DGKDQ16760 1214 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms