RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FBXO27	Q8NI29	283 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FATE1	Q969F0	183 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CFAP36	Q96G28	342 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LRGUK	Q96M69	825 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM7	Q9C029	511 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	AAAS	Q9NRG9	546 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DISC1	Q9NRI5	854 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KRT82	Q9NSB4	513 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	STIM2	Q9P246	746 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MCF2L	O15068	1137 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GRIN3B	O60391	1043 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ADAMTS4	O75173	837 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SMC2	O95347	1197 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	P4HA1	P13674	534 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ARFIP1	P53367	373 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KCNMA1	Q12791	1236 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB17	Q13105	803 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MTERF2	Q49AM1	385 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398		Q6ZVU0	165 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC80	Q76M96	950 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NLRP10	Q86W26	655 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	MYCT1	Q8N699	235 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RIN3	Q8TB24	985 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HIC2	Q96JB3	615 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SGCZ	Q96LD1	299 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SPON2	Q9BUD6	331 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	BRD9	Q9H8M2	597 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PPT2	Q9UMR5	302 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	COG5	Q9UP83	839 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GPR34	Q9UPC5	381 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SLC12A8	A0AV02	714 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	E2F8	A0AVK6	867 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM75P	A6NK02	468 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398		H0Y626	953 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398		H0YC42	278 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB43	O43298	467 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	3.62	□□□□□ -1.83	1e-6	■■□□□ 12.6
TTC3-214	ENST00000472398	HSPA6	P17066	643 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SMPD1	P17405	629 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	SOX5	P35711	763 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	HSD17B2	P37059	387 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	STAT1	P42224	750 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NPTX2	P47972	431 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CD83	Q01151	205 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ATP2B2	Q01814	1243 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	ADCY1	Q08828	1119 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	TRAF1	Q13077	416 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	NNT	Q13423	1086 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	PPP2R5E	Q16537	467 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC102B	Q68D86	513 aa		3.62	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms