RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469403.1

AGRN-205, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 3

Gene AGRN, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-205ENST00000469403 PDGFCQ9NRA1 345 aa30.04■■■□□ 2.4
AGRN-205ENST00000469403 KCNH7Q9NS40 1196 aa30.04■■■□□ 2.4
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AGRN-205ENST00000469403 PRR16Q569H4 304 aa30.03■■■□□ 2.4
AGRN-205ENST00000469403 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
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AGRN-205ENST00000469403 SENP7Q9BQF6 1050 aa30.02■■■□□ 2.4
AGRN-205ENST00000469403 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
AGRN-205ENST00000469403 FAM184BQ9ULE4 1060 aa30.02■■■□□ 2.4
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AGRN-205ENST00000469403 TBX3O15119 743 aa30■■■□□ 2.39
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AGRN-205ENST00000469403 ARP10275 920 aa30■■■□□ 2.39
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AGRN-205ENST00000469403 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
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AGRN-205ENST00000469403 ZNF577Q9BSK1 485 aa29.96■■■□□ 2.39
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AGRN-205ENST00000469403 CEP131Q9UPN4 1083 aa29.93■■■□□ 2.38
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AGRN-205ENST00000469403 GGPS1O95749 300 aa29.92■■■□□ 2.38
AGRN-205ENST00000469403 RARBP10826 455 aa29.92■■■□□ 2.38
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