RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 IL31RAQ8NI17 732 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CAGE1Q8TC20 777 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC9A7Q96T83 725 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 THEGQ9P2T0 379 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SGSM2O43147 1006 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 CKBP12277 381 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF5BP33176 963 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 THPOP40225 353 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 SP2Q02086 613 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 IKBKEQ14164 716 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 PPTC7Q8NI37 304 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 VWCEQ96DN2 955 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 MTMR8Q96EF0 704 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BRB1 525 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 PRC1O43663 620 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 CYTH3O43739 400 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 RGS20O76081 388 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 BAIAP3O94812 1187 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 TGFB3P10600 412 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 RXRAP19793 462 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 MCM5P33992 734 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 ANTXR2P58335 489 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 TROAPQ12815 778 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 PTK7Q13308 1070 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP4K1Q92918 833 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 ASB2Q96Q27 587 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 TNFRSF10AO00220 468 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 NBNO60934 754 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 RSPH10BP0C881 870 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 GNAQP50148 359 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB103AP81534 67 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 TAP1Q03518 808 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 NEDD9Q14511 834 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 KRT40Q6A162 431 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 NLRX1Q86UT6 975 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 SESTD1Q86VW0 696 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 TMTC2Q8N394 836 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 LY9Q9HBG7 655 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 CDH23Q9H251 3354 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 HAS3O00219 553 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC27A2O14975 620 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 DDAH1O94760 285 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 UPP2O95045 317 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 F2P00734 622 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 LGALS2P05162 132 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 CTSHP09668 335 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.86□□□□□ -0.83
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