RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	HAS3	O00219	553 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	PITPNM1	O00562	1244 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	SORBS3	O60504	671 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB43	O43298	467 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	F2	P00734	622 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	HSPA4	P34932	840 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	BFSP2	Q13515	415 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	MFSD10	Q14728	455 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	RETREG2	Q8NC44	543 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	ALG1	Q9BT22	464 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	PFKM	P08237	780 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF286B	P0CG31	522 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	DNAJB2	P25686	324 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	FUT2	Q10981	343 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	SEMA3F	Q13275	785 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	RTN1	Q16799	776 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	C7orf31	Q8N865	590 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	FIBP	O43427	364 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	NEFL	P07196	543 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	IQCF3	P0C7M6	154 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	RFC2	P35250	354 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	NEDD9	Q14511	834 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	PBX4	Q9BYU1	374 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	CPA1	P15085	419 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	RCAN1	P53805	252 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	UBE2S	Q16763	222 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	NLRX1	Q86UT6	975 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	CAGE1	Q8TC20	777 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	TIFA	Q96CG3	184 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	REC8	O95072	547 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	PBX2	P40425	430 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	METTL7B	Q6UX53	244 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580		Q6ZUG5	572 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDC27	P30260	824 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	FGD1	P98174	961 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF576	Q9H609	170 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		27.57	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	RBL2	Q08999	1139 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	FBXL16	Q8N461	479 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	GPRASP2	Q96D09	838 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	GPR20	Q99678	358 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP26	Q9BXU7	913 aa		27.56	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580		H3BRB1	525 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	LGALS2	P05162	132 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	APOBR	Q0VD83	1088 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	PTK7	Q13308	1070 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	GRIN2C	Q14957	1233 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	RAB30	Q15771	203 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	MYLIP	Q8WY64	445 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	MSRA	Q9UJ68	235 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		27.55	■■■□□ 2
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBBX	A8MT70	800 aa		27.54	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms