RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	GJA10	Q969M2	543 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	FGD4	Q96M96	766 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MGAM	O43451	1857 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964		B4DLN1	442 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	STAM2	O75886	525 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	EDNRB	P24530	442 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	TEC	P42680	631 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	NDUFA8	P51970	172 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	AK8	Q96MA6	479 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	NR1I2	O75469	434 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	AR	P10275	920 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	TXLNA	P40222	546 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	PDE4D	Q08499	809 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	MTMR1	Q13613	665 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	STXBP2	Q15833	593 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	USP49	Q70CQ1	688 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC5A5	Q92911	643 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	POTEM	A6NI47	508 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	COBL	O75128	1261 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SYK	P43405	635 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	VAV3	Q9UKW4	847 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-208	ENST00000420964	ASB14	A6NK59	587 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	GAS7	O60861	476 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	RGS20	O76081	388 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	UBA7	P41226	1012 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PDIA5	Q14554	519 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MORN1	Q5T089	497 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	RIT2	Q99578	217 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A087X0B3	334 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PSMD10	O75832	226 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF202	O95125	648 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CDC25A	P30304	524 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CABP7	Q86V35	215 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-208	ENST00000420964	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19

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