RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC174Q6PII3 467 aa4.47□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.47□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.47□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.47□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 FEZ1Q99689 392 aa4.46□□□□□ -1.69
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 USP11P51784 963 aa4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 PRR16Q569H4 304 aa4.46□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 DYMQ7RTS9 669 aa4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.46□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 CHURC1Q8WUH1 139 aa4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 PNMA5Q96PV4 448 aa4.46□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.46□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.46□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 RWDD2AQ9UIY3 292 aa4.46□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 CD2APQ9Y5K6 639 aa4.46□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM49BA6NDI0 452 aa4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 KCNB1Q14721 858 aa4.46□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 NR1I3Q14994 352 aa4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 ADSSL1Q8N142 457 aa4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 SH2D4AQ9H788 454 aa4.46□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 STK4Q13043 487 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.45□□□□□ -1.7
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LRRTM4-201ENST00000409088 PADI6Q6TGC4 694 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNK18Q7Z418 384 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 WNT2BQ93097 391 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 TEPSINQ96N21 525 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS16Q9H269 839 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 HACL1Q9UJ83 578 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.45□□□□□ -1.7
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GTH6 734 aa4.45□□□□□ -1.7
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