RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FAM20AQ96MK3 541 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 FBXO40Q9UH90 709 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 STAT6P42226 847 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 GRB10Q13322 594 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 POSTNQ15063 836 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 ISM2Q6H9L7 571 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 PNMA5Q96PV4 448 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 ZIC5Q96T25 663 aa22.69■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 TOMM70O94826 608 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A27O95847 323 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 CCDC192P0DO97 292 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 GRM1Q13255 1194 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 SLC5A5Q92911 643 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 RAB34Q9BZG1 259 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 PFASO15067 1338 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 EML1O00423 815 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 PSMD10O75832 226 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 RGS20O76081 388 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 MTMR1Q13613 665 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 JADE2Q9NQC1 790 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 CHMP2AO43633 222 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 CCND2P30279 289 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 KCNK18Q7Z418 384 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 KRT79Q5XKE5 535 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 POTEB2H3BUK9 544 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 GAS7O60861 476 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 ATP9AO75110 1047 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 MED24O75448 989 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 BCRP11274 1271 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 FGD4Q96M96 766 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 MMP19Q99542 508 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-202ENST00000405333 MCM3APO60318 1980 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 POTEB3A0JP26 581 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 SEMA3FQ13275 785 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 POTEBQ6S5H4 581 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 CALML4Q96GE6 196 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 MROH8Q9H579 483 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 USP25Q9UHP3 1055 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 CPA4Q9UI42 421 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 PLXNB2O15031 1838 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 CUL4BQ13620 913 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 KANK3Q6NY19 840 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 DNERQ8NFT8 737 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 CYP4A11Q02928 519 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 KCTD2Q14681 263 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ODC1-202ENST00000405333 MAF1Q9H063 256 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.1 ms