RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CDC27P30260 824 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ADCY7P51828 1080 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 FPGSQ05932 587 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 AP3B2Q13367 1082 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD1Q15327 319 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM199Q8N511 208 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 BICD2Q8TD16 824 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 COPS5Q92905 334 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 BADQ92934 168 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA33Q96N06 139 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 C6orf50Q9HD87 102 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.75□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SMCO2A6NFE2 343 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CPLX1O14810 134 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 GGPS1O95749 300 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CPA1P15085 419 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 METTL7BQ6UX53 244 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SESTD1Q86VW0 696 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 IL31RAQ8NI17 732 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 IL17RAQ96F46 866 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 GRIN2DO15399 1336 aa9.74□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 STXBP3O00186 592 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CDKL5O76039 1030 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMC6P62333 389 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 BFSP2Q13515 415 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NTRK3Q16288 839 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 C7orf31Q8N865 590 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 IL27Q8NEV9 243 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 HIPK3Q9H422 1215 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NOD1Q9Y239 953 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.73□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PITPNM1O00562 1244 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 B4GALT4O60513 344 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 DEXIO95424 95 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 F2P00734 622 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PFKMP08237 780 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 GNAT1P11488 350 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PTGS1P23219 599 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 RFC2P35250 354 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SREBF1P36956 1147 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PSEN2P49810 448 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SP2Q02086 613 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2SQ16763 222 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 GALNT17Q6IS24 598 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 RETREG2Q8NC44 543 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 CAGE1Q8TC20 777 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 KAT2BQ92831 832 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ANO3Q9BYT9 981 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 TRPV6Q9H1D0 765 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 IL23AQ9NPF7 189 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 JADE2Q9NQC1 790 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 LTBP2Q14767 1821 aa9.72□□□□□ -0.85
MT-TS1-201ENST00000387416 H3BRB1 525 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 HAS3O00219 553 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 MEIS1O00470 390 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP3A4P08684 503 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 ITGB8P26012 769 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF76P36508 570 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 MTMR1Q13613 665 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 MFSD10Q14728 455 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 SHHQ15465 462 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 PKN1Q16512 942 aa9.71□□□□□ -0.86
MT-TS1-201ENST00000387416 PTGISQ16647 500 aa9.71□□□□□ -0.86
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