RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.93■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.93■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 DNERQ8NFT8 737 aa22.93■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 FERMT2Q96AC1 680 aa22.93■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.93■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 CHMP2AO43633 222 aa22.92■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 CCND2P30279 289 aa22.92■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 MAPK4P31152 587 aa22.92■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 SP2Q02086 613 aa22.92■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.92■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 JADE2Q9NQC1 790 aa22.92■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 A0A1W2PQ27 194 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 A0A1W2PQ64 194 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 A0A1W2PQD8 194 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 COPB2P35606 906 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 58.5
TMCO3-201ENST00000375391 DPP9Q86TI2 863 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 EML1O00423 815 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 MAP2K2P36507 400 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 PRPHP41219 470 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 CCL14Q16627 93 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 TRIM47Q96LD4 638 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 HPSEQ9Y251 543 aa22.91■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 LAD1O00515 517 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 EDNRBP24530 442 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 C1QTNF8P60827 252 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 ECM1Q16610 540 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 STRNO43815 780 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 CYP2B6P20813 491 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 STXBP2Q15833 593 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 VAV3Q9UKW4 847 aa22.9■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.89■■□□□ 1.26
TMCO3-201ENST00000375391 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 ALDH1A1P00352 501 aa22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 HSPA6P17066 643 aa22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 PSMC4P43686 418 aa22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 PDE4DQ08499 809 aa22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 LONRF3Q496Y0 759 aa22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 MORN1Q5T089 497 aa22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 GJD2Q9UKL4 321 aa22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 GABRQQ9UN88 632 aa22.89■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 FOXN1O15353 648 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 PSMD10O75832 226 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF202O95125 648 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 SP4Q02446 784 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 ARMCX2Q7L311 632 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 SLC5A5Q92911 643 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 IWS1Q96ST2 819 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 ARIH2O95376 493 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 STAMQ92783 540 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 MAML3Q96JK9 1138 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.88■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 SYKP43405 635 aa22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 DHX58Q96C10 678 aa22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 MBD3O95983 291 aa22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 LY6KQ17RY6 165 aa22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.86■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 GAS7O60861 476 aa22.86■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 CASP1P29466 404 aa22.86■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 CYP4A11Q02928 519 aa22.86■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.86■■□□□ 1.25
TMCO3-201ENST00000375391 FAM20AQ96MK3 541 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms